为深入贯彻习近平总书记关于“抓住机遇、迎难而上，努力把中国医学科学院建设成为我国医学科技创新体系的核心基地”重要指示精神，坚持科技创新“四个面向”和全面落实京津冀协同发展战略，2021年5月10日，天津市人民政府与中国医学科学院北京协和医学院于共同签署了《共建中国医学科技创新体系核心基地天津基地合作协议》，在津共建天津基地这一重点工程项目。天津医学健康研究院（以下简称“健研院”）以“健康中国”战略为指导、以体制机制创新为主线，为天津基地的核心组成组分，统筹管理院校在津的各科研机构和医疗院所。

健研院是天津市政府直属的正局级公益二类事业单位，于2021年8月经中央编办正式批复成立，由市政府委托市科技局管理。2021年12月，中国医学科学院北京协和医院批准成立中国医学科学院天津医学健康研究院，与天津医学健康研究院实施一体化管理。

根据三定方案，健研院设党政综合部(机关党委办公室)、战略规划部、科研教育部、财务运营部、成果转化部、信息资源部、资产管理部和人力资源部8个内设机构，事业编制限额500名。主要职责有：1、围绕医学健康科学发展中的重大问题，开展基础医学、公共卫生与预防医学、干细胞与再生医学、放射医学、输血医学、康复医学、重大疾病诊疗医工结合等方面前瞻性、战略性、前沿性创新研究；2、围绕贯彻落实国家医学健康产业政策，组织开展重大产业项目实施和特色产业群建设；3、组织建设医学健康高水平智库，为市委，市政府和有关部门、单位提供决策咨询建议和相关服务；4、承担中国医学科技创新体系核心基地天津基地统筹协调工作，承担中国医学科学院北京协和医学院在津科技、医疗、教育有关战略规划、研究与转化以及学科建设、人才引育等方面协调管理工作。开展医学健康研究和科技创新领域广泛合作，促进科技成果转移转化；5、开展医学健康研究领域人才培训与学术交流；6、承办市委、市政府交办的其他事项。